Omicron, the new variant of the SARS-COV-2, reaction of the European Union and influence of open access data

    Omicron, the new variant of the SARS-COV-2, reaction of the European Union and influence of open access data

    臺歐盟科研專欄

    Akram Ashyani 博士後研究員(Life science Platform) 2021年12月16日

    Figure 1. COVID-19, licensed under CC0 Public Domain [1].

     

    SARS-CoV-2 於 2019 年 12 月在中國武漢開始流行,已在全球蔓延,迄今已有超過 2.7 億例病例和 531 萬例死亡。[2]

    儘管努力通過疫苗接種和非藥物介入措施(Non-pharmaceutical Interventions)來限制感染,但病毒仍在繼續模仿、傳播並出現新的病毒變種。

    最近變種的 B.1.1.529 被世界衛生組織的病毒進化技術諮詢小組(TAG-VE)命名為 Omicron,於 2021 年 11 月 26 日被確認為值得關注的變種,並引起了世界各地科學家的注意。 [3]

    嚴重案例的增加,尤其是未接種疫苗的病例增加,給醫院帶來了巨大壓力,並且已經使醫療保健專業人員負擔過重。這對非 COVID 患者的健康有直接影響,因為治療 COVID-19 個體的要求再次嚴重阻礙了其他疾病的治療。 Omicron 毒株帶來的額外潛在危險加劇了這些擔憂,強調了應對這一流行病的必要性,以推進歐盟及其他地區的長期健康安全。[4]

    歐盟執委會主席馮德萊恩(Ursula von der Leyen)認為,快速增長的 COVID-19 病例數正在給醫院和醫療保健系統帶來負擔,而變種病毒 Omicron甚至將進一步加深負荷。就她所見,歐盟有能力解決這些問題。同時,她重申了她的緊急要求,要求每個人都透過接種疫苗、加強免疫和遵守規定來保護自己。[4]

    馮德萊恩主席說:「集體行動的精神是抗擊此一流行病和對抗未來流行病的唯一真正有力的答案。我們在 5 月的 G20 全球衛生峰會 (G20 Global Health Summit) 上開始了其中的一些工作,世界主要經濟體在峰會上發誓要共同努力,使其成為最後一場全球大流行病。隨著當天簽署的《羅馬宣言》 (Rome Declaration),我們承諾從這場大流行中吸取教訓,為未來做好更好的準備。這就是為什麼我歡迎世界衛生大會的決定開始談判一項國際協議或其他國際文書,以加強大流行的預防、準備和應對。」[5]

    馮德萊恩主席支持計劃中的改進和新的全球健康安全和大流行防範金融中介基金(New financial intermediary fund for global health safety and pandemic preparedness)。從明年開始,歐盟歡迎包容性多邊談判。她指出,面對跨境健康威脅的國際合作以及非洲在傳遞其調查結果方面的分析努力和開放態度是實現全球快速反應和挽救許多生命的一個很好的例子。她說,根據5 月全球衛生峰會達成的協議,歐盟同意支持公平和善治原則,並且上個月在羅馬舉行的 G20 峰會上重申了這一點。在本次 G20 峰會上,歐盟及其成員國達成了 2022 年全球疫苗接種率達到 70% 的協議,他們將支持測序(Sequencing)、檢測(Testing)、治療(Treatments)和疫苗接種(Vaccination)的能力建設。[5]

    為實現此目標,歐洲的目標是與中低收入國家共享疫苗,到 2022 年年中至少提供 7 億劑疫苗。因此,他們協助創建了 ACT-Accelerator 並提供了 30 億歐元的資金,特別是透過 COVAX 用於全球疫苗接種,他們正在大力投資非洲的疫苗生產,並與南美進行疫苗生產。 [5]

    歐盟和成員國應對 COVID-19 的協調行動之一是確定並實施立即響應,包括快速獲取必要的指導方針。 [4]

    南非對大流行的最初症狀反應迅速,於 2020 年 2 月建立了一個國家基因組網絡(National Genomics Network),以追踪 SARS-CoV-2 的出現。 CERI (Centre for Epidemic Response & Innovation)中心主任 Tulio de Oliveira 表示,南非的基因監控(Genomics surveillance)對於識別 Omicron 和 Beta 變異是至關重要的並且儘快引起國際社會的關注。他認為世界領導人不應該懲罰開放科學,他說:「你應該真正鼓勵世界科學的透明度。」[6]

     

    Figure 2. Omicron variant, License under CC0 Public Domain [7].

     

    政府打算增加對 COVID-19 項目的資助,例如流行病學研究和基因監測,並支持與其他國家專家合作的更多機會。包括歐盟在內的世界各國政府一直在採取措施開放研究,使其更加透明,促進國際合作,並將科學置於期刊付費牆之外。[6]

    歐洲執委會對 COVID-19 危機的一些相關Calls是“Pandemic preparedness” [8] 和“Support for the functioning of the Global Research Collaboration for Infectious Disease Preparedness (GloPID-R)” [9],將於 2022年1月12 日開放申請,截止日期為2022 年 4 月 21 日下午5點〈布魯塞爾時間〉。

    聯合國文教組織 (UNESCO) 發布了第一個全球開放研究框架,旨在加強跨境合作。 UNESCO鼓勵 193 個聯合國成員國投資開放科學基礎設施,建立有針對性的區域和國際融資計劃,並保證所有公共資助的研究都遵守開放科學原則。[6]

    根據UNESCO自然科學助理總幹事Shamila Nair-Bedouelle指出,國際科學合作將幫助各國應對我們這個時代的挑戰,但因 Omicron 的發現而斷開與南非交通聯繫的決定可能會阻礙開放的研究合作。[6]

    UNESCO總幹事Audrey Azoulay在公佈開放科學的第一個全球定義時強調,在 COVID-19 時期,科學界公開獲取科學出版物、數據共享和合作可以加速研究並加強社會與科學政策之間的聯繫。[10]
    該框架已獲得 193 個國家的批准,允許科學家在開放許可下共享他們的文章、數據、軟體和硬體。 因此,科學將變得更加透明和易於獲取,以及平等和包容。[10]

     

    Figure 3. “Open science” can combine different practices and movements aimed at making multilingual scientific knowledge and increase scientific collaborations. (Image from [11] p. 8).

     

    據Audrey Azoulay說,這將改善國際科學合作。“UNESCO對於開放科學的建議將推動更廣泛地採用開放實踐,鼓勵更多地支持開放科學,並確保研究成果惠及所有人。”[10]

    雖然 70% 的科學期刊現在被鎖定在付費牆後面,但在過去兩年中,COVID-19 出版物的這一數字已降至 30% 左右,這表明研究可以更容易獲得。[10]

    在有UNESCO框架之前,開放科學沒有統一的定義,標準僅在地區、國家或機構層面確定。透過批准該框架,193 個國家承諾遵循共同規範並創建單一路徑。簽署方將每四年報告一次進展情況。[10]

    References:

    [1] Tmaximumge, “coronavirus,” 17 04 2020. [Online]. Available: https://pxhere.com/en/photo/1608792. [Accessed 16 12 2021].
    [2] “WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard,” World Health Organization, 28 11 2021. [Online]. Available: https://covid19.who.int/. [Accessed 16 12 2021].
    [3] “Update on Omicron,” World Health Organization, 28 11 2021. [Online]. Available: https://www.who.int/news/item/28-11-2021-update-on-omicron. [Accessed 16 12 2021].
    [4] “Commission reiterates calls to step up vaccination, rapid deployment of boosters, vigilance and rapid reaction to Omicron variant,” European Commission, 01 12 2021. [Online]. Available: https://cyprus.representation.ec.europa.eu/news/commission-reiterates-calls-step-vaccination-rapid-deployment-boosters-vigilance-and-rapid-reaction-2021-12-01_en. [Accessed 17 12 2021].
    [5] “Speech by President von der Leyen at the World Health Assembly,” European Comission, 29 11 2021. [Online]. Available: https://ec.europa.eu/commission/presscorner/detail/en/speech_21_6423. [Accessed 16 12 2021].
    [6] F. Zubașcu, “‘Do not blame South Africa’ for the Omicron variant,” Science, business, 02 12 2021. [Online]. Available: https://sciencebusiness.net/news/do-not-blame-south-africa-omicron-variant. [Accessed 16 12 2021].
    [7] “Virus Covid-19 Omicron New Variant Pandemic,” Max Pixel, [Online]. Available: https://www.maxpixel.net/Virus-Covid-19-Omicron-New-Variant-Pandemic-6863757. [Accessed 16 12 2021].
    [8] “Pandemic preparedness,” European Commision, [Online]. Available: https://ec.europa.eu/info/funding-tenders/opportunities/portal/screen/opportunities/topic-details/horizon-hlth-2022-disease-07-02;callCode=null;freeTextSearchKeyword=infecsioe%20disease;matchWholeText=false;typeCodes=1,2;statusCodes=31094501,31094502;prog. [Accessed 17 12 2021].
    [9] “Support for the functioning of the Global Research Collaboration for Infectious Disease Preparedness (GloPID-R),” European Commission, [Online]. Available: https://ec.europa.eu/info/funding-tenders/opportunities/portal/screen/opportunities/topic-details/horizon-hlth-2022-disease-07-01;callCode=null;freeTextSearchKeyword=Pandemic%20preparedness%20;matchWholeText=true;typeCodes=1,2;statusCodes=31094501,3109450. [Accessed 17 12 2021].
    [10] “LIVE BLOG: R&D response to COVID-19 pandemic, COVID-19 pushes UNESCO framework on open science over the line,” Science, Business, 02 12 2021. [Online]. Available: https://sciencebusiness.net/live-blog/live-blog-rd-response-covid-19-pandemic-september-2021?page=1&entry=11408#live-blog-entry-11408. [Accessed 16 12 2021].
    [11] UNESCO, “UNESCO Recommendation on Open Science,” 2021. [Online]. Available: https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000379949.locale=en. [Accessed 16 12 2021].

     

     

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